Prirodnjačko odeljenje počelo je sa svojim radom pri Vojvođanskom muzeju 1947.godine. Svoju lokaciju je menjalo sve do 1966.godine kada je osnovan Pokrajinski zavod za zaštitu prirode u Novom Sadu sa sedištem na Petrovaradinskoj tvrđavi.
Delatnost prirodnjačkog odeljenja odnosi se na prikupljanje predmeta za zbirke, naučno-istraživački radovi, proučavanje predmeta, formiranje studijskih zbirki. Prirodnjačka zbirka predstavlja most koji spaja muzejsku delatnost i zaštitu prirode u okviru Zavoda.
Fond prirodnjačke zbirke danas broji preko 25 hiljada predmeta razvrstanih u nekoliko zasebnih zbirki: geološko-paleontološka, mineraloška i petrološka zbirka, herpetološka, ornitološka i teriološka zbirka, botanička, entomološka, ihtiološka. One se svakodnevno konstantno, još od osnivanja Pokrajinskog zavoda, dopunjavaju novim predmetima i vrstama biljnog i životinjskog porekla.
Za posetioce prirodnjačka izložba otvorena je svakim radnim danom od 08 do 16 časova. Grupne i najavljene posete se mogu organizovati i subotom.